高新企業申報的四個階段：
階段一
資料審核與評估
審核基本信息及現有資料；確定高新認定工作重點及難點。
階段二
知識產權的審核，可申報的知識產權匯總；審閱相關知識產權的時效性與關聯性。
階段三
研發項目的選擇、 確定及證明材料的準備，確定可證明公司科研能力的近三年的研發項目；根據已確定的研發項目確定高新領域（目錄第三級）；根據確定的項目準備立項報告、RD、PS表等技術資料；確定項目對應的成果轉化資料并補充；確定需要備案的技術服務合同并安排備案；企業高新技術產品（服務）的關鍵技術與技術指標的具體說明書。
階段四
研發費用歸集、高新收入確認，根據確定的項目匡算近三年研發費用總額；確定實際高新收入比例；協助溝通現場審計事項。
階段五
其他人事、制度材料的整理，確認員工花名冊以及科技人員的比例；整理部分科技人員學歷、職稱證書；準備上一年度社保繳納證明；整理企業研發管理水平的證明材料，包括研發項目組織管理制度、研發投入核算體系、產學研協議、科技成果轉化組織實施與激勵獎勵制度、科技人員績效考核制度等；整理研發設備清單及購買發票。
階段六
申報及后續跟進，整體梳理申報材料；網上填寫并申報；提交材料，后續跟進。
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